Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
EllO08856 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
EllO08856 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EllO08856 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
EllO08856 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
EllO08856 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms