Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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MsmbO08540 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MsmbO08540 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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