Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm5849J3QPE5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5849J3QPE5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms