Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm21976J3QNN2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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