Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Gm20918J3QN17 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Gm20918J3QN17 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Gm20918J3QN17 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Gm20918J3QN17 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Gm20918J3QN17 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Gm20918J3QN17 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Gm20918J3QN17 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm20918J3QN17 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm20918J3QN17 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Gm20918J3QN17 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm20918J3QN17 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20918J3QN17 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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