Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top6blJ3QMY9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Top6blJ3QMY9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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