Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21818J3KMS6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms