Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20828J3KMI7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms