Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp17ldG5E8G2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms