Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vmn1r58G3X9U3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms