Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2610008E11RikG3X964 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms