Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.02■□□□□ -0
XntrpcF8VQM8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XntrpcF8VQM8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms