Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp9yF8VPU6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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