Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm28038F7BCN9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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