Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm2564F6Z9S8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms