Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10378F6XQQ1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms