Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pate1E9Q658 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pate1E9Q658 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pate1E9Q658 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pate1E9Q658 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pate1E9Q658 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pate1E9Q658 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms