Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Speer4f2E9Q366 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Speer4f2E9Q366 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms