Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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