Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Ddx60E9PZQ1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddx60E9PZQ1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms