Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbf2E9PXF8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms