Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc8E9PWG2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms