Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms