Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms