Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfx8D3YU81 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms