Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11bB4XVQ1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11bB4XVQ1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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