Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap58B2RW38 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms