Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brpf3B2KF05 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms