Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CK137956B1AYM9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms