Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms