Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Plcb2A3KGF7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Plcb2A3KGF7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms