Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Atp8b5A3FIN4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Atp8b5A3FIN4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Atp8b5A3FIN4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Atp8b5A3FIN4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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