Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palm3A2TJV2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms