Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r232A2RTT5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms