Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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