Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samt1A2BED8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms