Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Rtf1A2AQ19 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Rtf1A2AQ19 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Rtf1A2AQ19 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Rtf1A2AQ19 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtf1A2AQ19 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms