Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tubb1A2AQ07 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tubb1A2AQ07 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tubb1A2AQ07 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tubb1A2AQ07 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tubb1A2AQ07 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tubb1A2AQ07 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tubb1A2AQ07 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubb1A2AQ07 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tubb1A2AQ07 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Tubb1A2AQ07 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tubb1A2AQ07 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tubb1A2AQ07 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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