Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms