Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms