Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ckap5A2AGT5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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