Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb4A2A863 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb4A2A863 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms