Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit3W8DXL4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrit3W8DXL4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms