Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slc22a4Q9Z306 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc22a4Q9Z306 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc22a4Q9Z306 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms