Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Crlf3Q9Z2L7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Crlf3Q9Z2L7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms