Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Robo3Q9Z2I4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Robo3Q9Z2I4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Robo3Q9Z2I4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Robo3Q9Z2I4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Robo3Q9Z2I4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms