Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hmg20bQ9Z104 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hmg20bQ9Z104 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hmg20bQ9Z104 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms