Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xpr1Q9Z0U0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Xpr1Q9Z0U0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xpr1Q9Z0U0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 460.3 ms