Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVJ9

Efemp2, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp2Q9WVJ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efemp2Q9WVJ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Efemp2Q9WVJ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efemp2Q9WVJ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efemp2Q9WVJ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efemp2Q9WVJ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efemp2Q9WVJ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efemp2Q9WVJ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efemp2Q9WVJ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efemp2Q9WVJ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efemp2Q9WVJ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efemp2Q9WVJ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efemp2Q9WVJ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efemp2Q9WVJ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms