Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnip1Q9WUU8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tnip1Q9WUU8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnip1Q9WUU8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnip1Q9WUU8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms